Felsefe Ana Bilim Dalı Yüksek Lisans Programı 2012 yılında öğrenci alımına başlamıştır. Ana Bilim Dalımız 2016-2017 eğitim-öğretim yılından başlayarak “Felsefe Tarihi ve Sistematik Felsefe” ile “İslam ve Türk Felsefesi” olmak üzere iki ayrı program ile yüksek lisans eğitimini sürdürmektedir.